Benjamin wurde am 12. September 1978 in Austin (Texas) geboren. Wo er mit seinen Eltern, Frances (Autorin) und Pete (Rechtsanwalt) Schenkkan und seinen beiden kleineren Brüdern, Nate (22, Schauspieler) und Zack (17, Student), aufwuchs. Sein Onkel, Robert Schenkkan, war ein berühmter Drehbuchautor.

Ben heißt mit richtigen Namen eigentlich Benjamin McKenzie Schenkkan, da er Schauspieler werden wollte aber ein anderer Schauspieler Benjamin Schenkkan hieß, entschloss sich Ben einen Schauspielnamen anzulegen und hieß nun Benjamin McKenzie.  

Er ging in Austin auf die High School, später ging er an die Universität in Virginia wo er Internationale Beziehungen und Wirtschaft studierte, nebenbei spielte er an der Uni regelmäßig im Theater mit. Als er mit seinem Uni-Abschluss fertig war zog er nach New York, um seinen Traumjob zu verwirklichen, nämlich die Schauspielerei.  

Er stand in verschiedenen Produktionen von Williamstown Theatre auf der Bühne und spielte in "Life is a Dream", "Street Scene" und "The Blue Bird" mit.  

Schließlich zog es Ben nach Los Angeles, wo er vorrübergehend bei einem Freund wohnen konnte und bekam Gastauftritte in "J.A.G" und "The District“. Seinen Durchbruch schaffte er mit "The O.C.", nachdem er 4 mal für die Rolle vorsprach konnte er die Produzenten endlich überzeugen und bekam die Rolle. Nun sind sie gerade dabei die 3. Staffel zu drehen und Ben hat einen Vertrag über 6.Staffeln. Ben sagt über das Vorsprechen: "Ich bin einfach zum Vorsprechen gegangen und habe nicht versucht, jemanden zu beeindrucken - im Gegensatz zu meinen vorigen Vorsprechen. Ich glaube, deshalb habe ich die Rolle bekommen...“ Nach dem sie die 2. Staffel von The O.C. gedreht haben änderte er seinen Namen auf Ben McKenzie um.